== Handlung ==
Ein Schiff der Yashiro Handelsgesellschafft sinkt aufgrund einer Kollision mit einem Eisberg. Es sinkt mit dem Geheimnis vom Mord am Kapitän.
14 1/2 Jahre später fällt Schiffsbauingeneur Hideto Yashiro mit seinem Auto eine Klippe hinunter.
Noch ein halbes Jahr später sticht das Schiff "Aphrodite" in See. An Bord sind [[Kogoro Mori|Kogoro]], [[Ran Mori|Ran]], [[Conan Edogawa|Conan]], [[Hiroshi Agasa|Professor Agasa]], die [[Detective Boys]] und [[Sonoko Suzuki|Sonoko]]. Nach einem Ausspruch von Conan denkt Ran an ein Erlebnis mit [[Shinichi Kudo|Shinichi]] in ihrer Kinderzeit zurück. Währenddessen zieht ein Mann in seinem Zimmer ein großes Messer und noch etwas Anderes aus seinem Waffenkoffer. Beim Abendessen erfährt man, dass der Mann Hironari Kusaka heißt und Drehbuchautor ist; außerdem bekommt Conan vom Professor Manschettenknöpfe mit Lautsprech- und Abhörfunktion. Er ist in Begleitung der Ingenieurin Minako Akiyoshi. Nach dem Essen geht er zurück auf sein Zimmer, da er seekrank ist. Zumindest behauptet er das, aber anstatt das zu tun, dringt er in die Royal Suite ein um ein Abhörgerät anzubringen.
Kogoro ist dann auch mal wieder sturzbetrunken und Conan und der Professor bringen ihn ins Bett, während die Detective Boys entscheiden Ran eine Goldmedallie aus Muscheln zu basteln, dafür dass sie ein Karateturnier gewonnen hat.
Der Präsident Yashiro bekommt eine mysteriöse, anonyme Nachricht, die auf den Schiffsunfall vor 15 Jahren anspielt. Daraufhin werden er und die Frau Direktorin von Hironari umgebracht, der sich durch ein Tonband ein Alibi verschafft.
Währenddessen spielen Ran, Sonoko und die Kinder Verstecken. Sonoko und [[Ai Haibara|Ai]] müssen suchen, wobei Sonoko niedergeschlagen wird. Conan und die Anderen finden sie halb erfroren in der Leichenhalle des Schiffes.
Kurz darauf findet Kogoro die Leiche der Frau Direktorin und schließt, dass auch dem Präsidenten Yashiro etwas passiert sein könnte. Sie rufen die Polizei und Conan lauscht heimlich den Ermittlungen. Nachdem er sich eingemischt und die Polizisten auf die richtige Spur gebracht hatte, beschloss [[Juzo Megure|Megure]] Herrn Kusake zu befragen.Doch er hat ein Alibi. Allerdings findet Conan heraus, dass es ein Trick wahr.
Sonoko erholt sich und Ran erzählt ihr eine Geschichte aus der Grundschule, wonach nur Shinichi imstande ist sie zu finden.
Kurz vor der Begrüßungsfeier, kommt die Polizei hinter das Geheimnis des Mordes an Hideto Yashiro und sie finden die Leiche des Präsidenten.
Auf der Party ist großer Aufruhr wegen den Morden, doch Kogoro bittet die Gäste sich zu beruhigen und verdächtigt öffentlich Minako Akiyoshi, doch Conan löst den Fall mit Hilfe von Professor Agasas Stimme auf. Kusake allerdings droht das Schiff sinken zu lassen, falls sie nicht tun was er sagt. Nach einem riskanten Manöver eines Crewmitglieds zündet er die Bomben und das Schiff sinkt. Der Mörder versucht mit einem Boot zu fliehen, doch die Detective Boys verfolgen ihn. Conan betäubt ihn und die Polizei nimmt ihn fest. Auf dem Boot kommt ihm ein Geistesblitz, der ihn erkennen lässt, dass Kusake nicht der eigentliche Täter ist, sondern Minako. doch als Conan zurück zum Schiff fährt, stellt Kogoro sie bereits. Auf dem Schiff wird Conan bewusst, dass Ran nicht aufzufinden ist. Sie ist bewusstlos geworden, als sie die Goldmedallie der Kinder gesucht hat. Conan sucht sie. Wird er sie finden und mit ihr rechtzeitig vom Schiff fliehen können?
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